Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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