Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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