Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms