Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FAM3AP98173 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms