Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms