Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRMP28827 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms