Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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