Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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PRAMEF10O60809 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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PRAMEF10O60809 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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PRAMEF10O60809 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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PRAMEF10O60809 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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PRAMEF10O60809 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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PRAMEF10O60809 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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PRAMEF10O60809 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PRAMEF10O60809 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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