Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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HOXA3O43365 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXA3O43365 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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