Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SALL4Q9UJQ4 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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