Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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SH3BP4Q9P0V3 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
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SH3BP4Q9P0V3 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SH3BP4Q9P0V3 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SH3BP4Q9P0V3 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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