Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SPHKAPQ2M3C7 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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