Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CTF1Q16619 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms