Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TAF1AQ15573 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms