Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDCD1Q15116 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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