Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 POU6F2-201ENST00000403058 2335 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 NOX4-210ENST00000527956 2379 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPS23P8-201ENST00000429775 330 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC018638.4-201ENST00000465971 1150 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RN7SL77P-201ENST00000473332 294 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC100843.1-201ENST00000475372 550 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC068531.1-201ENST00000502398 195 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MIR3663-201ENST00000583207 97 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC002480.4-201ENST00000414116 2592 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RTP3-201ENST00000296142 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 KCNA2-215ENST00000640956 1584 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 IARS2P1-201ENST00000508226 3173 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CLEC4M-204ENST00000359059 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LINC02292-201ENST00000554522 1701 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LRRC37A11P-201ENST00000425901 3580 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC011297.1-201ENST00000620503 2110 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ZNF233-201ENST00000391958 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SNCA-201ENST00000336904 3041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FKBP1AP3-201ENST00000423650 319 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC011330.1-201ENST00000510070 3235 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 WWC1-209ENST00000521089 3562 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC005779.1-201ENST00000591569 540 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC073218.2-201ENST00000606468 295 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL031281.2-201ENST00000606754 748 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms