Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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