Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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BPTFQ12830 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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BPTFQ12830 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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