Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms