Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TMPOP42166 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
TMPOP42166 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TMPOP42166 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TMPOP42166 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TMPOP42166 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms