Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PTPRGP23470 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRGP23470 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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