Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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PTPRFP10586 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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PTPRFP10586 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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PTPRFP10586 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PTPRFP10586 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PTPRFP10586 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRFP10586 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PTPRFP10586 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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