Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms