Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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