Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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CCDC96Q2M329 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC96Q2M329 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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