Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CRADD-211ENST00000552983 839 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL049820.1-201ENST00000442936 423 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL5P3-201ENST00000493817 889 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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