Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SS18Q15532 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SS18Q15532 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SS18Q15532 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SS18Q15532 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SS18Q15532 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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