Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TRERF1-204ENST00000372922 7286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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RYR3Q15413 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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RYR3Q15413 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RYR3Q15413 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RYR3Q15413 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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RYR3Q15413 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RYR3Q15413 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RYR3Q15413 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RYR3Q15413 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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