Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms