Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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