Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CDH18Q13634 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CDH18Q13634 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CDH18Q13634 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CDH18Q13634 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CDH18Q13634 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CDH18Q13634 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDH18Q13634 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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