Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms