Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
DUSP4Q13115 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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