Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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TRAF1Q13077 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TRAF1Q13077 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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