Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms