Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F1Q01094 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms