Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ACADSBP45954 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms