Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NMBRP28336 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms