Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXA2O43364 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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