Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms