Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms