Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms