Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDGFDQ9GZP0 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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