Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CIPCQ9C0C6 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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