Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
LRRIQ1Q96JM4 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms