Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms