Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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