Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms