Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SS18Q15532 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SS18Q15532 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms