Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SYCP1Q15431 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SYCP1Q15431 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms